Questiona-se sobre a adequação do sistema de avaliação das ações de indução em saúde adotado pelo Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Tem-se como objetivo geral identificar a percepção dos principais atores envolvidos no processo avaliativo das referidas ações. A pesquisa é um estudo de caso do Edital 38/2004 – Saúde Bucal. Para coleta de dados, entrevistaram-se coordenadores de projetos financiados, pesquisadores avaliadores e gestores analistas de Ciência e tecnologia do Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico e do Ministério da Saúde que participaram do ciclo avaliativo do referido edital. Infere-se que os instrumentos utilizados no sistema de avaliação das ações induzidas possibilitam gerar informações relevantes para a condução e tomada de decisões de futuras ações em saúde. Na opinião dos atores, os instrumentos estão adequados, mas podem ser aprimorados e o processo de avaliação está parcialmente apropriado. Aponta-se para a necessidade de adequação do método de avaliação para a inclusão de outros atores, além dos pares, na Comissão de Avaliação. Concluiu-se que os procedimentos de avaliação estão voltados para verificar a potencialidade de aplicação dos resultados e produtos dos projetos financiados nas ações de indução.